重庆医科大学中医药学院组建于2001年，是重庆市唯一具有本科-硕士-博士-博士后和留学生教育完整体系的中医药高等教育基地，现有1个一级学科博士专业学位授权点（中医学），2个一级学科硕士学位授权点（中医学、中西医结合）；2个省级重点一级学科（中医学、中西医结合）；5个普通高等教育本科专业； 1个重庆市特色专业，1个重庆市特色学科专业群；2个重庆市“一流专业”（中医学、中药学）； 1个省级重点实验室（中医药防治代谢性疾病重庆市重点实验室）。
学院下设中医、中药、针灸推拿3个系，拥有一批知名的中医药教学、科研和临床专家。其中，重庆市学术技术带头人3人，重庆市学术技术带头人后备人选1人，教育部教指委委员2人，重庆市名中医1人，重庆市各学会会长、副会长、理事等30人次，博士生导师5人，硕士生导师23人，在校本科生2000余人，研究生100余人。
近年来，学院获得包括NSFC在内的各级科研课题140余项；发表包括SCI期刊在内的学术论文520余篇，出版专著40部。获教研项目14项；发表教学论文70余篇；拥有国家级精品网络视频公开课程1门，重庆市精品课程1门，重庆市研究生优质课程1门，校级优质课程5门；获重庆市教委批准建设“重庆医科大学附属永川中医院中医专业学位研究生联合培养基地”、“重庆市中医学专业学位研究生教学案例库”和“中医学研究生导师团队”3个研究生教学建设项目，主编全国高等中医药教材10部、副主编和参编教材56余部。
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